隧道式巴氏殺菌機是一種處理那些已經灌裝好了的容器方法。巴氏殺菌機沒有經過處理的產品灌裝進容器，并將容器封好蓋，然后，通過輸送帶的傳送，進入隧道式巴氏殺菌機的內部。
在巴氏殺菌機中的各個溫度區域內，巴氏殺菌機產品的溫度受到精細的調節。當通過隧道時，容器受到不同溫度水的噴淋，也就是加熱階段、殺菌階段和冷卻階段。 巴氏殺菌機前端的逐步加熱和后端的逐步冷卻是非常重要的。
巴氏殺菌機這樣，既可以避免過熱而造成的口味損失，又能夠防止容器熱應力的突變而產生的碎瓶。在隧道式巴氏殺菌機中，巴氏殺菌機一般可以采用三種熱傳遞方法：一種是噴淋板上面帶有許多噴淋孔（可稱之為：噴淋板系統），熱水通過噴淋板噴淋到容器上；另一種是安裝一個大型的噴淋嘴（可稱之為：噴淋嘴系統），熱水通過這個噴淋嘴噴淋到容器上；第三種是在四方的噴淋管上面開設槽口（可稱之為：噴淋桿系統），熱水通過噴淋桿噴淋到容器上。
目前，最為常用的是噴淋板系統，這種系統結構簡單、實用。噴淋桿系統同樣具有噴淋水分布均勻的特點；由于噴淋嘴系統的結構簡單、堅固，因此，噴淋嘴系統的維護保養比較方便。
